Estos estudios tienden a conocer la variabilidad espacio-temporal de los diferentes parámetros que comprenden la dinámica y los procesos biológicos, ecológicos, físicos y químicos que alteran la columna de agua, de tal manera que se puedan elaborar modelos que expliquen y permitan conocer sus efectos sobre el clima y los recursos.
Los estudios de Caracterización Oceanográfica se iniciarán con la recopilación de los parámetros físicos superficiales del mar y en la columna de agua de los principales puertos y bahías del margen continental e insular ecuatoriano. Estos parámetros incluyen la determinación de las corrientes superficiales y sub-superficiales empleando equipos de medición de corrientes denominados Correntómetros; este es conocido como el método Euleriano. Existe y otra metodología utilizando flotadores a la deriva, a este se lo conoce como el método Lagrangiano. El objeto de estas mediciones es el de establecer el régimen de circulación superficial y sub-superficial del área de estudio, determinando su magnitud y dirección predominante y la influencia que esta ejerce en los procesos costeros de la zona litoral. Los productos del análisis de corrientes se traducen en tablas estadísticas de corrientes promedios y máximos y cartas de circulación superficial y subsuperficial.
Otra tarea fundamental en este contexto es la caracterización de la estructura subsuperficial poco profunda del lecho marino del área de estudio, identificando y cuantificando los estratos sedimentarios y otras estructuras sub-superficiales.
De la misma forma se determina la altura de las olas del sector por medio del uso de un sensor de presión denominado Olígrafo. Esta medición tiene el propósito de determinar las condiciones predominantes del oleaje en términos de altura y período significativo y dirección predominante. La serie de datos obtenida es sometida a un análisis espectral que busca la obtención de tablas estadísticas de altura y periodo significativo de olas, Gráficos de las características del régimen de oleaje y Diagramas de refracción.
