Estos estudios tienden a conocer la variabilidad espacio-temporal de los diferentes parámetros que comprenden la dinámica y los procesos biológicos, ecológicos, físicos y químicos que alteran la columna de agua, de tal manera que se puedan elaborar modelos que expliquen y permitan conocer sus efectos sobre el clima y los recursos.
Realizar un estudio integral de las características físicas, hidrográficas, oceanográficas, hidrológicas y ambientales de dos de los principales puertos del margen costero continental e insular ecuatoriano, así como de las cuencas hidrográficas más importante del país, tanto en la región costera como amazónica, con el fin de obtener la información base a partir de la cual se pueda elaborar mediante la aplicación de sistemas de información geográfica mapas temáticos, cartas náuticas y otros productos cartográficos que podrán ser empleados en la determinación de Áreas Protegidas, Áreas de Reserva, Áreas Sensibles y Áreas de desarrollo Turístico por las diferentes instituciones competentes, estos productos servirán también como herramientas para optimizar el empleo de los recursos y el establecimiento de políticas adecuadas en la gestión, monitoreo, conservación, manejo, comercialización, explotación y protección de nuestros recursos naturales en beneficio de la sociedad, en concordancia con las normas ambientales establecidas para tal efecto.
La evolución y situación actual de la investigación de los océanos y de los diferentes cuerpos de agua ya sean continentales, oceánicos o fluviales requiere la aplicación de un Plan estratégico de investigación que este acorde con los nuevos retos y nuevas normas internacionales establecidas por los organismos internacionales que regulan este tipo de investigación, tal es el caso de la Organización Hidrográfica Internacional (OHI), Comisión Oceanográfica Intergubernamental (COI), Organización Marítima Internacional (OMI), Asociación Cartográfica Internacional (ICA), entre otras.